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科学家们的宝贵思想和近代科学实验的兴起 ， 极大地促进了16、17世纪自然科学的发展 ， 和新的哲学观的产生 。
首先 ， 这一时期 ， 物理学、天文学、数学等多个自然科学领域里 ， 诞生了伽利略、培根、牛顿、笛卡尔等科学巨匠 ， 他们在研究过程中所采用的新科学方法 ， 将人们的思维从之前的宗教神学中解放出来 。
以科学实验所取得的成果为基础 ， 科学家们不再单纯地以感性为认识手段 ， 判断思维正确与否的唯一标准 ， 成为了是否通过科学实验来验证 。 而自然观在这一时期 ， 逐渐形成一种与希腊时期的自然观相对立的新观念 。
培根是英国经验派的哲学家 ， 他对自然的认识可以说具有划时代的意义 。 因为在他之前 ， 人们对于自然的认识 ， 对于世界的看法 ， 基本上是被宗教神学观蒙蔽着双眼 ， 对于上帝的信仰几乎是盲从的 ， 认为上帝创造了一切 ， 并且世间一切都以此为逻辑出发点 ， 上帝创造了整个世界 。 但是 ， 到了培根这里 ， 他提出了新的自然观 。
首先 ， 他提出对自然的物质性的肯定 。 他认为自然是物质的 ， 世界的本原是物质 ， 物质具有永恒性 ， 并处于永无止境的运动中 ， 物质具有其内在客观规律 ， 人们只有通过科学实验的方法 ， 才能够正确的认识到它 。 培根的这种带有朴素性的唯物主义 ， 对后世尤其是经验论的影响很大 。
其次 ， 在对于人与自然的关系认识上 ， 培根主张人应该通过观察和实验 ， 来归纳客观事实 ， 从而获得知识 ， 而借助这些知识来真正的认识自然 。
培根有句名言：“知识就是力量” 。 我认为 ， 这里所说的“知识” ， 是通过实验后来得出有关自然的原本面目的知识 ， 是“自然知识” 。 这可以说是培根在认识论上 ， 对感性与理性之间的关系的认识 。
作为一个虔诚的宗教信徒 ， 培根却能够打破宗教的束缚 ， 提出新的认识方法论 ， 并认为自然是物质的 ， 而不是具有神力的 。 这种自然观 ， 在当时被宗教神学观所笼罩的思想界来说 ， 不得不是一个具有开创新局面意义的声音 。
这一时期的自然观 ， 更加注重自然的“自然界”这一内涵 ， 并且开始对希腊哲学家所主张的 ， 认为主宰世界的是一种“本性”的东西产生质疑 ， 质疑的同时他们也提出自己的主张 。
在这一时期的哲学家看来 ， 控制这个世界的并不是这些形而上的东西 ， 而是一种物质的东西 ， 这种物质性的东西又由其内在的规律所控制着 ， 整个世界就是被一种外在的力量控制着 。
在希腊时期被哲学家们认为 ， 自然界是一个生命机体的观念 ， 在这一时期完全不被承认 。 新的自然理论主张用动因 ， 来分析和揭示事物的运动过程 ， 也就是说 ， 任何事物的运动过程 ， 都是由于其在运动之初 ， 就具有这种使物质运动的作用 。
新时期自然观的哲学家们 ， 坚持自然的一切变化必须通过这种方式来解释 。 这一时期的哲学家们认为自然界是一部机器 ， 这部机器由各个零部件组 ， 并且按照一定的规则和秩序 ， 朝着一个确定的方向运转着 。
在这里 ， 虽然新时期的哲学家们 ， 也用到了“秩序”“规则”等义项 ， 但是与古希腊时期 ， 所认为的这种力量来自于自然本身不同 ， 他们认为这中力量是来自自然之外的 ， 或者说 ， 是自然之外的超越者 ， 他们称之为“上帝” 。
是上帝设计了一套理论 ， 设计好了一切事物运动时 ， 所遵循的规律和秩序 ， 而自然界只是被上帝纳入这个体系当中 ， 并且完全遵守这样的运动规律 ， 它是被动的 ， 被操纵的 ， 就像是一架被操纵着的机器一样 。
自然就作为由上帝创造的、按照一定规律而运行的世界出现 ， 上帝和人都站在自然的对面 。 这种自然观 ， 被称作机械论的自然观 。
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