在南北朝时期，齐国是叫南齐还是叫齐？有何来源？
当时人的称呼，主要参考当时的正史 。
基本上是国号（同时并立的时候也会加上东、西，比如东西魏同时存在，《周书》里用过东魏的称呼，《梁书》《资治通鉴》用过西魏的称呼，以区别东西魏；或者先后存在，用前、后区别，《隋书》里就称拓跋魏为后魏，以跟曹魏区别）、皇帝的姓或者姓名代指国家、地名（也是不承认对方正统性的一种表现），这几种 。有时候加上侮辱性的称呼 。
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后面我们细细来说 。
一、两个齐政权的地理位置和年代550年，高氏篡夺了中原地区拓跋氏的东魏政权，建立齐政权 。这个政权延续到581年，被北周吞并 。
【在南北朝时期，齐国是叫南齐还是叫齐？有何来源？】在此之前，萧道成479年在南方篡夺了刘氏宋政权，也建立了一个齐政权 。这个政权只存在了20余年，502年被萧衍创建的梁政权取代 。
后世对这两个政权的称呼，一般以二十四史的名称为准 。对这两个政权，二十四史中，按地理位置的南北之分，分别以《北齐书》《南齐书》来称呼 。
由于北齐建立时，南齐政权已经灭亡了，他们相互之间，至少南齐是没法对北齐有官方称呼的 。
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二、当时人的称呼
涉及这一阶段的正史书籍，主要有《魏书》《北史》《周书》《北齐书》《南齐书》《隋书》《南史》《梁书》《陈书》等 。
1.以对方皇帝的姓氏或名字称呼由于政权的对立，自命正统的政权一般称对方为伪朝 。当割据政权太多的时候，史官为回避这个问题，就以别的国家皇帝的姓氏代指国家，避免尴尬 。
比如，《北齐书 卷三 帝纪第三》
“西求救于宇文，南请援于萧氏”
分别以宇文和萧氏代指西魏政权和南方的萧梁政权 。
而《魏书》因为自命正统，一律斥东晋及南朝为伪朝，说得就更不客气，直接就是称呼对方皇帝的名字 。比如《魏书 帝纪第八 世宗》：
萧宝卷豫州刺史萧叔业以寿春内属
萧宝卷就是南齐的皇帝 。这种直呼其名的称呼就很不客气了 。
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2.以国号称呼对方
这个是比较常见的称呼 。比如说对方派谁来做什么
“梁湘东王萧绎....”
和北齐并立的北周史书《周书》里称北齐，直接用国号齐 。比如
盗杀齐文襄于邺，其弟洋讨之 。
说的是高欢被杀的事，直接用国号称呼 。
《隋书》称北齐为齐 。不过隋书已经算南北朝以后的称呼了 。
南方，继承南齐的梁，对南齐也是直接称国号 。《梁书》叙述梁武帝萧衍生平，说萧衍他爹
齐高帝族弟也
而随后，对北齐，《梁书》也直接称国号，并不叫北齐 。比如《梁书 本纪第六》
齐遣其上党王高涣送贞阳侯萧渊明来主梁嗣
说的是北齐扶植傀儡的事 。
《陈书》也直呼北齐国号为齐，并不叫北齐 。比如《陈书 本纪第一》
齐遣辛术围严超达于秦郡
《资治通鉴》编年时，采用了东晋到宋齐梁陈的顺序，但到《陈纪》，并未称北齐为北齐，而是直接以齐称之 。
3.侮辱性的称呼《魏书》自命承接西晋正统，对南朝各代皇帝一律斥为“岛夷” 。给刘裕、萧道成、萧衍等人做的列传也称为《岛夷列传》 。
《魏书 帝纪第七》说，（北魏）太和三年
岛夷萧道成废其主刘准而僭立，自号曰齐
其他网友观点毛笋应邀答题:
这个问题我前面已答，因为这个历史时期，東晋已亡，各诸侯混战，分裂成南朝和北朝 。随即进入南北朝，他们分别是:南朝:(420一479)
宋(420一479)、齐(479一502)、梁(502一557)、陈(557一589) 。
共四国，因地域在南方，故称南朝 。如南宋(非大宋赵构南宋)、南齐、南梁、南陈 。
北朝:(368一581)
北魏(386一534)[拓跋氏，后改元氏) 。北魏建国于386年1月，初称代国，至同年4月始改国号为魏，439年灭北凉，统一北方 。
北魏(386一534)、东魏(534一550)、北齐(550一577)，高姓，非南齐萧姓、西魏(535一556)、北周(557一581)共五国 。因地域在北方，故称北朝 。后随文帝杨坚581灭南北各朝，(除了南陈)建隋于581年 。后589年灭南陈，完成统一 。
晋元熙二年(東晋恭帝司马德文)，公元420年，東晋灭亡 。中国分裂为南北两部分，即南朝和北朝，前面已述 。北周大定元年(581)隋代北周 。隋开皇九年(589)文帝杨坚
灭南北朝最后一个国家南陈，全国复归统一 。凡南北朝首尾共一百七十年 。
这就是南齐的来源，南齐和北齐无任何关係，南齐姓萧，开国皇帝萧道成 。北齐姓高，开国皇帝高洋 。
至于南北朝各皇帝的详情就不述了 。
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其他网友观点
南北朝有两个齐国，分别是南朝萧齐和北朝高齐 。
南齐北齐的「南北」，是后人为了区别同名政权加以识别用的词，当时的人是不会这么叫的，他们的国号都是齐 。
就如同单位里有两个张三，一老一小，可以叫大张三，小张三，但他们的身份证写的都是「张三」，没有大小之分 。
南齐建国在先，当时没别的齐国，所以说当时齐国就是指南齐 。
北齐建国在后，出于自身本位制考虑，说齐国自然就是指北齐，要称呼历史上出现过的齐，要加上别的词加以识别 。
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