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【?进化组合学根据定义将提供大量潜在的替代状态】许多在进化中看起来很新的东西在某种程度上是微不足道的 ， 因为很多工作已经完成 ， 分子系统的先验可用性和基因复制的最重要作用是生命多功能性潜力的很大一部分 。 将进化想象成更像是一个工厂车间 ， 组件分散在各处 ， 诀窍是手头有一套正确的“计划” 。 因此 ， 在分子水平上已经有很多可用的了 。 这种固有的概念与共同选择的熟悉的进化主题有关 ， 其中一个被大量引用的例子是眼睛晶体蛋白 。 在这里 ， 各种蛋白质 ， 通常是酶 ， 与热休克等应激功能相关 ， 在晶状体和角膜中找到了新的用途 。
然而 ， 从一些硬骨鱼眼中发现的凝溶胶蛋白可以看出这种选择的范围和多功能性 ， 在这里 ， 与其他晶状体蛋白一样 ， 它们具有透明性 ， 但凝溶胶蛋白具有多种其他功能 ， 包括参与肌动蛋白 。 分子固有的程度和重要性可能仍然被低估了 。 例如 ， 就涡虫的神经系统进化而言 ， 不仅这种“原始”扁虫的基因与人类之间存在广泛的重叠 ， 而且同样重要的是 ， 这些基因中约有30%是已知的在无神经植物和真菌中 。 就动物神经系统内的主要功能类别而言 ， 在每个类别中使用的基因的代表都出现在这些其他领域中 。
但将这些称为“神经基因”就没有抓住重点 ， 因为细胞通讯和囊泡形成等问题远远超出了神经系统 。 同样重要的是 ， 分子固有的对应物是分子的多功能性 ， 即在多种情况下使用相同的结构 。 握褶提供了一个很好的例子 ， 说明了通常被称为“瑞士军刀综合症”的情况 ， 在这里 ， 对这种现象的近似解释也可能是相当微不足道的 ， 并且围绕着诸如结合特性和对特定底物的构象等问题进行 。 即便如此 ， 我怀疑这种分子多功能性的明显机会主义可能掩盖了更深层次的秩序原则 。 无论如何 ， 这些观察结果呼应了一组称为“进化的大锅” 。
这可能表明 ， 虽然进化转变在后果方面可能确实是深刻的 ， 但在过程方面并不一定如此 ， 但是“大锅”的概念 ， 或者实际上是“坩埚” ， 是有信息量的 ， 因为它可以作为进化过程的隐喻 ， 遵循“咒语”或化学论文 。 保证结果的不仅是适当的成分 ， 而且是采用适当组合的方式 ， 越来越明显的是 ， 无论是在发育模块还是形态模块方面 ， 组合重排导致似乎几乎是无限的机智 。 在前一种情况下 ， 人们可以想到“眼睛基因”被用于肌肉发育 ， 而在导致高度成功的生态形态的功能整合方面 ， 仙人掌提供了一个很好的例子 。
再一次重点是 ， 虽然进化组合学根据定义将提供大量潜在的替代状态 ， 但现实是在现实世界中绝大多数可能是不可行的 。 同样重要的是 ， 组合的可能性可能由本身不能立即适应的组织规则决定 。 因此 ， 在所有进化枝中 ， 我们看到进化在不同的尺度上不断重复 ， 而进化枝学家所说的同质性是猖獗的 ， 这并不奇怪 。 吨 。 然而 ， 关于进化枝内的多样化进行方式的另一个方面被相对忽视 ， 即使这与发展计划有关 ， 更重要的是进化被限制遵循特定轨迹的可能性 。 因此 ， 在任何多样化中 ， 看到分别被认为是“原始”或“高级”的字符并置是很常见的 。
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